R包—iGraph
时间:2022-05-04
本文章向大家介绍R包—iGraph,主要内容包括其使用实例、应用技巧、基本知识点总结和需要注意事项,具有一定的参考价值,需要的朋友可以参考一下。
这几天收到师兄的任务,熟悉iGRaph包的使用,通过查资料,外加自己的实践,在此做个简单的学习笔记。 以下例子均是在R 3.0.1版本下测试的。
1.用igraph创建图表
g<- graph(c(1,2, 1,3, 1,4, 2,4, 3,4), directed=T)
> g IGRAPH D--- 4 5 --
> plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold)
2.创建多种图形的图表
> g1 <- graph.full(4) > g1 IGRAPH U--- 4 6 -- Full graph + attr: name (g/c), loops (g/x)
> g2 <- graph.ring(3) > g2 IGRAPH U--- 3 3 -- Ring graph + attr: name (g/c), mutual (g/x), circular (g/x)
> g3 = graph.lattice(c(3,4,2))#create a lattice > g3 IGRAPH U--- 24 46 -- Lattice graph + attr: name (g/c), dimvector (g/n), nei (g/n), mutual (g/x), circular (g/x)
>g4 = graph.tree(50, children=2)#create a tree > g4 IGRAPH D--- 50 49 -- Tree + attr: name (g/c), children (g/n), mode (g/c)
>plot(g4,layout=layout.fruchterman.reingold,vertex.label.dist=0.3,edge.arrow.size=0.5,vertex.color="red")
3.随机图表和优先连接的生成
> g <- erdos.renyi.game(20, 0.2)#create a random graph and fix probability
> g IGRAPH U--- 20 43 -- Erdos renyi (gnp) graph + attr: name (g/c), type (g/c), loops (g/x), p (g/n)
> plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold, vertex.label=NA, vertex.size=5,vertex.color="green")
> g <- erdos.renyi.game(20, 15, type='gnm')# Generate random graph, fixed number of arcs > g IGRAPH U--- 20 15 -- Erdos renyi (gnm) graph + attr: name (g/c), type (g/c), loops (g/x), m (g/n)
> plot(g, layout=layout.reingold.tilford, vertex.label=NA, vertex.size=5,vertex.color="green")
4.简单图表的算法
g <- erdos.renyi.game(12, 0.35) > g IGRAPH U--- 12 21 -- Erdos renyi (gnp) graph + attr: name (g/c), type (g/c), loops (g/x), p (g/n)
> E(g)$weight <- round(runif(length(E(g))),2) * 50#Create the graph and assign random edge weights
> mst <- minimum.spanning.tree(g)#Compute the minimum spanning tree > mst IGRAPH U-W- 12 11 -- Erdos renyi (gnp) graph + attr: name (g/c), type (g/c), loops (g/x), p (g/n), weight (e/n)
最短路径算法:
> pa <- get.shortest.paths(g, 5, 9)[[1]]
> pa
[1] 5 3 9
> V(g)[pa]$color <- 'green'
> E(g)$color <- 'grey'
> E(g, path=pa)$color <- 'red'
> E(g, path=pa)$width <- 3
> plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold)
> plot(mst, layout=layout.reingold.tilford, edge.label=E(mst)$weight)
> plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold, edge.label=E(g)$weight)
http://blog.sina.com.cn/s/blog_60034d4a0101e12h.html
- Linux系统下yum镜像源环境部署记录
- 特斯拉vs凯迪拉克vs奔驰:三大汽车自动驾驶系统比拼
- Centos下添加静态路由(临时和永久有效)的操作记录
- python如何保证输入键入数字
- 微信小程序自定义数据分析试水
- 挂载银行前置机Ukey到windows server2012虚拟机的操作记录
- 文件上传速度查询方法
- “AS3.0高级动画编程”学习:第三章等角投影(上)
- su: 无法设置用户ID: 资源暂时不可用
- NumPY学习笔记
- LVS负载均衡下session共享的实现方式-持久化连接
- Centos6.9下RabbitMQ集群部署记录
- “AS3.0高级动画编程”学习:第三章等角投影(下)
- zabbix监控主机cpu达到80%后报警
- JavaScript 教程
- JavaScript 编辑工具
- JavaScript 与HTML
- JavaScript 与Java
- JavaScript 数据结构
- JavaScript 基本数据类型
- JavaScript 特殊数据类型
- JavaScript 运算符
- JavaScript typeof 运算符
- JavaScript 表达式
- JavaScript 类型转换
- JavaScript 基本语法
- JavaScript 注释
- Javascript 基本处理流程
- Javascript 选择结构
- Javascript if 语句
- Javascript if 语句的嵌套
- Javascript switch 语句
- Javascript 循环结构
- Javascript 循环结构实例
- Javascript 跳转语句
- Javascript 控制语句总结
- Javascript 函数介绍
- Javascript 函数的定义
- Javascript 函数调用
- Javascript 几种特殊的函数
- JavaScript 内置函数简介
- Javascript eval() 函数
- Javascript isFinite() 函数
- Javascript isNaN() 函数
- parseInt() 与 parseFloat()
- escape() 与 unescape()
- Javascript 字符串介绍
- Javascript length属性
- javascript 字符串函数
- Javascript 日期对象简介
- Javascript 日期对象用途
- Date 对象属性和方法
- Javascript 数组是什么
- Javascript 创建数组
- Javascript 数组赋值与取值
- Javascript 数组属性和方法
- 花狗C语言彩色贪吃蛇(完整代码)
- CodeForces - 262B
- CodeForces - 260B
- 蓝桥杯第九届C语言C组第一题:哪天返回
- java学习之路:17.掌握Boolean对象的创建以及Boolean类提供的各种方法
- java学习之路:16.掌握Integer,Long,Short对象的创建以及其类提供的各种方法
- java学习之路:15.对象的创建,属性,行为,引用,比较,销毁
- java学习之路:14.类的构造方法,静态变量,常量和方法,类的主方法
- java学习之路:13.类(成员变量,成员方法,权限修饰符,局部变量及有效范围,this关键字)
- 线性表--定长顺序串(十四)
- java学习之路:10.数组的基本操作(遍历,替换,排序,复制,查询)
- java学习之路:9.一,二维数组创建初始化
- 线性表--堆串(十五)
- 图解PostgreSQL-buffer管理(二)
- 同步复制注意点